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原位杂交探针设计 怎么设计原位杂交探针啊

来源:朵拉利品网  |  2019-06-28 18:06:35

1, 怎么设计原位杂交探针啊



1.探针分为好多种,你要先决定你用何种,是RNA探针还是DNA探针,杂交时,RNA-RNA结合的稳定性要比DNA-RNA好,所以RNA探针具有结合牢固、背景低等优点;DNA探针背景稍微深一些,不过也可以,标记方法比前者简单一些,另外还有寡核苷酸探针,此类探针分子量小,通透性好,但就是标记的敏感性不高。
2.原位杂交相比免疫组化,定位相对准确,但如果蛋白在间质中发挥作用,原位杂交就检测不出来了,结合图像分析,原位杂交也可以对目的基因的转录半定量。
3.首先是标本对照,这个包括阳性对照和阴性对照;第二个是探针对照,主要是明确探针的特异性;第三个是探针正义连阴性对照,第四个未标记探针竞争抑制;第五个不含探针的阴性对照;第六个质粒对照,第七个无关探针对照。
4.若要定量,该试验不可行,还是作Northern,若要显示形态、定位,最好结合免疫组化。
5.罗氏有试剂盒,还不错。

2, 荧光原位杂交探针和荧光探针有什么区别



荧光原位杂交探针和荧光探针有什么区别
荧光原位杂交技术问世于70年代后期,其曾多用于染色体异常的研究,近年来随着FISH所应用的探针钟类的不断增多,特别是全Cosmid探针及染色体原位抑制杂交技术的出现,使FISH技术不仅在细胞遗传学方面,而且还广泛应用于肿瘤学研究,如基因诊断基因定位等 。原有的放射性同位素原位杂交技术存在着较多缺点,诸如每次检验均 需重新标记探针,已标记的探针表现出明显的不稳定性,需要较和时间的曝光时间和对环境的污染等。在观察结果时,需要较多的分裂进行统计学分析。此外,由于放射性银粒和染色体聚集的不同平面,可能引起计数上的误差等。与之比FISH则具有:
①操作操作简便,探针标记后稳定,一次标记后可使用二年;
②方法敏感,能迅速得到结果;
③在同一标本上,可同时检测几种不同探针;
④不仅可用于分裂期细胞染色体数量或结构变化的研究,而且还可用于间期细胞的染色体数量及基因改变的研究等特点。

相关概念


探针

探针是一小段单链DNA或者RNA片段(大约是20到500bp),用于检测与其互补的核酸序列。双链DNA加热变性成为单链,随后用放射性同位素(通常用磷-32)、萤光染料或者酶(如辣根过氧化物酶)标记成为探针。磷-32通常被掺入组成DNA的四种核苷酸之一的磷酸基团中,而荧光染料和酶与核酸序列以共价键相连。

 
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